Шарко В.И. работал в системе высшего профессионального образования (в заводе-ВТУЗе Ростовского -на- Дону института сельхозмашиностроения, а затем академии с 1976 г. по 2003 г.. За это время им было разработано и прочитано пять курсов по общетехническим дисциплинам, издано свыше 10 методических пособий.

С 2003 года является директором авиационного колледжа, где проводит большую организационно-методическую и научную работу по интеграции процесса обучения в высшей и средней профессиональной школе, а также внедрению непрерывного профессионального образования и интегрированной (дуальной) системы обучения «колледж-предприятие», которая является уникальной системой образования в среднем профессиональном образовании, на что получено разрешение Управления учреждений образования Федерального агентства по образованию.

Работу в колледже Шарко В.И. совмещает с преподаванием в Ростовской -на- Дону государственной академии сельскохозяйственного машиностроения в качестве доцента по кафедре «Сопротивление материалов и детали машин». В 2004 году награжден нагрудным знаком «Почетный работник высшего профессионального образования Российской Федерации».

Область научных исследований Шарко В.И. – создание и использование экологически чистого пневмоконтейнерного, совершенно нового вида транспорта. Результатом исследований стали 40 опубликованных работ, среди которых 10 авторских свидетельства на изобретения, а также неоднократные рационализаторские предложения.