Замотайлов Александр Сергеевич в 1984 г. закончил с отличием факультет защиты растений Кубанского сельскохозяйственного института (ныне Кубанский государственный аграрный университет). С 1989 г. работал на различных должностях на кафедрах энтомологии и фитопатологии этого вуза, с 1998 г. по настоящее время исполняет обязанности заведующего кафедрой энтомологии КубГАУ, также является профессором кафедры физиологии Адыгейского государственного университета. С 1985 по 1988 гг. Замотайлов А.С. обучался в очной целевой аспирантуре в лаборатории систематики насекомых Зоологического института АН СССР (Ленинград, ныне Зоологический институт РАН), где выполнил диссертационную работу на тему «Жужелицы (Coleoptera, Carabidae) Северо-Западного Кавказа (фауна, экология, зоогеография)». Кандидатскую и докторскую диссертации защитил в 1990 и 2004 гг. соответственно в диссертационном совете при Зоологическом институте РАН. Ученое звание профессора присвоено в 2007 г. Замотайлов А.С. систематически совершенствует своей преподавательский и научный уровень, в частности, во время пребывания в МГУ, МПГУ, Научно-исследовательском зоологическом музее МГУ (Москва), СПГУ, СПГАУ, ВИЗР, Зоологическом институте РАН (Санкт-Петербург) и других образовательных и научных учреждениях России. Он также стажировался в естественноисторических музеях в Базеле и Люцерне (Швейцария), естественноисторических музеях и университетах в Праге (Чехия), Париже (Франция), Милане и Вероне (Италия) и Эрзуруме (Турция).

Замотайлов А.С. является ведущим специалистом в области систематики и филогении жужелиц и биоконсервации насекомых в России. Им описано около 150 неизвестных науке видов, 15 родов и 1 новая триба насекомых из различных районов мира. Практические результаты исследований отражены в Красных книгах России, Краснодарского края и Республики Адыгея и международных каталогах, составителем которых он является. А.С. Замотайлов - стипендиат Международного научного фонда по проблеме «Биоразнообразие», он проводит исследования по отдельным темам и проектам, которые были поддержаны или поддерживаются в настоящее время грантами и контрактами Международного научного фонда, правительства Российской Федерации, РФФИ, департаментов образования и науки, сельского хозяйства и перерабатывающей промышленности, биологических ресурсов, экологии и рыбохозяйственной деятельности Краснодарского края. Им опубликовано около 200 научных и научно-методических работ, включая ряд индивидуальных и коллективных монографий (в т.ч. большое количество публикаций в странах дальнего зарубежья). Как педагог Замотайлов А.С. пользуется заслуженным уважением коллег, студентов, аспирантов и других учеников, он подготовил в качестве научного руководителя 2 кандидатов наук. В настоящее время осуществляет научное руководство 4 аспирантами и соискателями, а также научное консультирование 3 докторантами.

Замотайлов А.С. также руководит Кубанским отделением Русского энтомологического общества при РАН (членом Совета которого он является), участвует в работе Российской академии естествознания в качестве члена-корреспондента. Он является сопредседателем Комиссии по редким и охраняемым объектам животного и растительного мира Краснодарского края, научным редактором второго издания Красной книги Краснодарского края. Он лауреат ряда российских научных конкурсов, награжден почетными грамотами и дипломами администрации Краснодарского края (1994, 1998, 2003), Министерства сельского хозяйства Российской Федерации (1997) и Министерства образования Российской Федерации (2001).