Работал в Ошском пединституте преподавателем, старшим преподавателем, доцентом, зав.кафедрой, деканом физико-математического факультета, директором института фундаментальных и прикладных исследований, проректором вечернего и заочного обучения ОшТУ, проректором по научной работе Ошского государственного университета.
В 1992 году избран на должность профессора.
В 1993 году защитил докторскую диссертацию.
В 1995 году присвоено звание профессора.
В 1998 году назначен проректором вечерно-заочного отделения Ошского технологического университета.
В 2001 году назначен проректором по научной работе Ошского государственного университета.
С 2007 года по настоящее время работает зав.кафедрой экспериментальной и теоретической физики Ошского государственного университета.
Под руководством Арапова Б. учениками и сотрудниками лаборатории «Физика конденсированных материалов» определены механизмы образования, взаимопревращения и распада дефектов в твердых телах и установлен эффект увлечения дырок катионными вакансиями в ионных кристаллах, который играет большую роль в определении оптических, электрических и радиационных свойств твердых тел. Результаты научных исследований опубликованы в пяти монографиях и более 133 статей в известных журналах, таких, как «Известий АН СССР, сер. Физическая», «Физика твердого тела», «Оптика и спектроскопия», «Известия вузов Физика», «Письма в ЖТФ», «Доклады АН РУз», «Известия НАН КР», «Наука и новая технология», а также в материалах многих Международных, республиканских и зональных научных конференций, совещаний и симпозиумов, а также в пяти авторских свидетельств и трех патентов.
Б.Араповым подготовлены три доктора наук и пять кандидатов наук, в настоящее время он руководит научной работой докторантов, аспирантов, стажеров и студентов.
При его непосредственном участии и руководстве проведены Региональные конференции физике кондесированного состояния, с участием ученых СНГ на базе лаборатории физики конденсированных материалов ОшГУ.
Арапов Б. ведет большую преподавательскую работу, читает лекции, проводит практические и лабораторные занятия по физике и теоретической физике на высоком научн. — методическом уровне. Подготовил учебное пособие по квантовой физике.
Принимает активное участие в подготовке высококвалифицированных кадров, являясь Председателем специализированного диссертационного Совета при Ошском государственном университетом и Зам.председателя Межведомственного диссертационного Совета при Институте физике НАН КР по защите диссертации на соискание ученой степени докторов и кандидатов наук.
Является научным руководителем научного проекта «Нур», координируемый Министерством образовании, науки и молодежной политики Кыргызской Республики, Кыргызского отделения Международного проекта «Пами. — Чакалтай», изучающий космические лучи.
За многолетний труд награжден медалями и Почетной грамотой Кыргызской Республики, является отличником образования, Заслуженным деятелем науки Кыргызской Республики.
Перечень кандидатских диссертаций
1. Осконбаев М.Ч.
Тема диссертации: «Роль вакансионных дефектов в распаде и преобразовании радиационных дефектов в кристаллах аС1-КСi». Бишкек, 1996 г.
2. АвиловА.
Тема диссертации: «Радиационное дефектообразование и квазихимические реакции в неметалических кристаллах». Бишкек, 2000 г.
3. Алтымышов А.
Тема диссертации: «Ионно-диффузионный механизм и кинетика термического распада радиационных центров окраски в ЩГК». Ош, 2004 г.
4. Омурбекова Г.
Тема диссертации: «Исследование и разработка технологии получения технического кремния из неорганических и органических сырьевых ресурсов». г. Ош, 2005 г.
5. Садырова М.М.
Тема диссертации: «Исследование групп преобразований и состав радиационно-наведенных электронных дефектов в ЩГК», г. Ош, 2009 г.
Перечень докторских диссертаций
1. Осмоналиев К.О.
Тема диссертации: «Люминесценция электрондых возбуждений и их распад с образованием дефектов в ионных кристаллах». Бишкек, 1999 г.
2. Тайиров М.М.
Тема диссертации: «Распад собственных и околопримесных электронных возбуждений в щелочно-галоидных кристаллах с экситонами малого радиуса». Бишкек, 2002 г.
3. Ташполотов Ы.
Тема диссертации: «Синергетика и фракталы микро и макроскопических конденсированных систем». Бишкек, 2004 г.
Опубликовано более 150 научных работ, среди них:
1. Арапов Б., Авилов А.Б., Оксенгендлер Б., Юнусов М. О возможностях образования разделенных пар Френкеля приподпороговом облучении. Доклады ВУЗ №5.Ташкент, 1999. с. 5–12.
2. Арапов Б, Арапов Т., Осконбаев М. Анионные дефекты, распад и тушения свечения центров в ЩГК. Бишкек, Наука и новые технологии. №2, 2002. с. 57–61.
3. Арапов Б., Арапов Т., Юнусов М. Особенности многостадийных процессов тушения свечения центров в ионных кристаллах. доклады АН ВУЗ, №2.Ташкент, 2002, С. 17–18.
4. Арапов Б., Садырова М., Каденова Б. Группа преобразований и состав электронных центров окраски и свечения в кристаллах в NаС1-Аg. Известия вузов. №1,2. Бишкек,2002, с. 26–29.
5. Арапов Б., Авилов А.Б., Оксенгендлер Б.Л., О роли динамического хаоса в рекомбинационно-стимулированных атомных процессах. Письма в ЖТФ. 2000. Т. 26.Вып 2. с. 23–27.
Научные монографии и учебные пособия
1. Осмоналиев К., Арапов Б. Люминесценция электронных возбуждений и их распад с образованием дефектов в ионных кристаллах. Изд. «Илим», Бишкек, 1999г, 182с.
2. Арапов Б., Авилов А., Оксенгендлер Б.Л. Радиационные дефектообразования и квазихимические реакции в неметаллических кристаллах. Изд. «Илим», Бишкек, 2003. 142с.
3. Ташполотов Ы., Арапов Б.А. Самоорганизация фрактальных конденсированных систем. Изд. «Илим», Бишкек, 2004, 132с.
4. Арапов Т.Б., Арапов Б.А.Механизм и кинетика свечения центров в ионных кристаллах Изд. «Илим», Бишкек, 2007, 158с.
5. Арапов Б., Усаров А.С., Жанибеков М.Ж.,и др. Образование, распад и взаимопревращения примесно-радиационных центров в ионных кристаллах. Изд. «Билим», Ош, 2007, 114с.
6. Арапов Б., Арапов Т.Б. Кванттык механиканын негиздери. «Билим» ОшМУ, г. Ош 2006, 146с.
7. Арапов Б., Осконбаев М.Ч ОшМУнун окумуштуулары, «Билим» ОшМУ, Ош-2006, 252с.
Патенты и авторские свидетельства
1. Арапов Б.А., Арапов Т., Осконбаев М., Садырова М.Криостат для низкотемпературной деформации твердых тел., Кыргызпатент, патент №558 28.02.2003 г.;
2. Арапов Б.А., Арапов Т., Ташкулов К., Камалов К. Способ измерения квантового выхода излучения и устройство его реализации. Подана заявка в Кыргызпатент.10 июль 2002 г.;
3. Малабаев А., Арапов Б. Комбинированный трубопровод . Кыргызпатент, Патент №914, 31.10.2006г.